AI проектуватиме білки проти раку, і Цукерберг віддає модель безкоштовно

Вчені з Chan Zuckerberg Biohub випустили у відкритий доступ масштабну модель біології білків під назвою ESMC за ліцензією MIT. Замість монетизації розробники дозволили будь-якій лабораторії світу безкоштовно завантажити систему, яка проектує унікальні молекули для боротьби з конкретними хворобами.

Модель тренували на 2,8 мільярда білкових послідовностей з усього древа життя, від глибоководних бактерій до людських клітин. Програма навчилася вгадувати, яку амінокислоту еволюція поставить наступною, і завдяки цьому зрозуміла фізичні правила згортання білків. Замість пошуку готових рішень у базах даних, AI створює абсолютно нові білки-«липучки» (біндери), які мають прикріпитися до пошкодженого білка в організмі та вимкнути його роботу.

За тривимірну структуру відповідає другий компонент системи — ESMFold2. Творці стверджують, що він точніше передбачає зв'язування антитіл із антигенами, ніж розпіарений AlphaFold 3 від Google DeepMind. Для перевірки систему нацькували на п'ять онкологічних та імунологічних мішеней, включаючи EGFR та PD-L1.

Лабораторні тести у пробірках підтвердили успішність білків: ефективність компактних міні-біндерів склала від 36% до 88%. Зазвичай на пошук одного такого кандидата вручну йде три-чотири роки нудної роботи, тоді як комп'ютер впорався за кілька днів.

Отримані молекули є лише кандидатами, а не готовими ліками, тому попереду на них чекають тривалі клінічні дослідження. Разом із моделлю розробники відкрили доступ до атласу ESM Atlas, що містить 6,8 мільярда білків та 1,1 мільярда передбачених структур.

Подібна щедрість у сучасній ІТ-індустрії виглядає майже аномально на тлі нескінченних платних підписок на дурні чат-боти. Тепер, коли науковий світ отримав безкоштовний інструмент такого рівня, традиційним фармацевтичним корпораціям буде значно важче виправдовувати свої космічні бюджети та десятиліття розробок.

Джерело: Chan Zuckerberg Biohub